Durante lo Spotlight dell’E3, Nintendo ha confermato che Super Mario Odyssey prevede una modalità co-op molto particolare. Il secondo giocatore può controllare Cappy, il cappello rosso di Mario, come fosse un personaggio a sè. Con i comandi giusti può farlo volare qua e là, attaccare i nemici e altre possibilità elencate a schermo. Cappy può fare cose non consentite a Mario, tra cui raccogliere note musicali prima che scompaiano per risolvere un puzzle.
Il game director Kenta Motokura ha voluto aggiungere tale feature in quanto ispirato dal supporto nativo di Switch per due controller. Chi controlla Mario avrà sempre a disposizione i movimenti tradizionali tra cui la corsa e il salto. Sembra che Mario possa ancora avere un certo controllo su Cappy, ma ciò non è stato mostrato nello streaming.